Iontový součin (produkt) vody je číslo, které udává následující: je to koncentrace ionizovaných molekul vody ve zcela čisté vodě je to součin koncentrací hydroxylových iontů a protonů, které vznikají ionizací molekul vody. Disociace kyseliny iontový součin snižuje je to rovnovážná konstanta disociace vody je to součin koncentrací hydroxylových iontů a protonů, které vznikají ionizací molekul vody. Disociace kyseliny iontový součin zvyšuje .
Mezi vlastnosti vody patří: nízké výparné teplo vzhledem k počtu vodíkových můstků led má nízkou hustotu, protože má méně vodíkových můstků hmyz na ní může bruslit, protože má vysoké povrchové napětí jsou v ní vyšší iontové interakce než ve vakuu velké povrchové napětí vyšší elektrostatické interakce ve vakuu .
Hydrofobní molekuly se shlukují ve vodě: klesne entropie vzroste entropie protože interakce mezi molekulami vody jsou větší než mezi vodou a tou látkou protože se navzájem přitahují síla kyseliny je určena její Ka slabé kyseliny plně disociují .
Co představuje sekvence (Gly-Pro-Hyp)n: elastin kolagen fibroin keratin.
Co stabilizuje sekundární strukturu proteinů? alfa helix - vodíkové můstky mezi CO a NH skupinou se opakují každé 4 jednotky alfa helix – vodíkové můstky mezi CO a NH skupinou se opakují každé 3 jednotky beta list - vodíkové můstky mezi CO a NH skupinou beta list - vodíkové vazby mezi CO a NH skupinou se opakují každé 2 jednotky .
Konformace proteinů: je jen jedna možná nativní se dosahuje působením enzymů – chaperonů se mění v průběhu enzymatického cyklu je ovlivněna pH .
Nukleofilní skupiny jsou: hydroxylová amino protonizovaná iminoskupina imidazolová skupina .
Stabilita proteinů: iontové síly přispívají hodně, protože jsou silné vodíkové můstky jsou slabé, a proto přispívají málo elektrostatické síly přispívají hodně hydrofobní interakce jsou slabé a přispívají proto ke stabilitě proteinů málo .
Fosforylace: se děje na zbytcích Cys, Ser a Tyr za spotřeby ATP jí dělají kinázy defosforylací se už ATP nedá získat mění izoelektrický bod .
Alanin má pKa 9.87 a 2.35. při pH (asi) 12 platí:
alanin bude zcela ionizován bude putovat v elektrickém poli při pH 2.38 putuje ke kladné elektrodě při pH 9.87 část ke kladné a část k záporné při pH 7 neputuje v elektrickém poli .
Proč jistá ryba z Antarktidy nemá hemoglobin: protože ve studené vodě není potřeba kyslík má jiné barvivo nepotřebuje jej, protože ve studené vodě je kyslík dobře rozpuštěn.
Při srpkovité anémii se vymění Val6 za Glu6, což způsobí: hemoglobin váže O2 při nízkém pO2 hemoglobin kyslík pevně naváže a nemůže ho ,,odvázat“ není stíněn náboj železa.
Myoglobin se od hemoglobinu odlišuje: má hem pevně vázaný v globinu má větší afinitu k O2 má FeII má Fe kovalentně vázané v porfyrinu .
Bohrův efekt: nenastává při navázání CO souvisí s uvolněním H+ při navázání CO2 uvolnění H+ z koncových COOH změnou konformace konců uvolnění H+ po navázání O2 v důsledku zrušení některých iontových vazeb .
Enzymy: snižují aktivační energii reakce prodlužují životnost přechodného komplexu zvyšují V0, ale neovlivní VM.
Do které třídy enzymů patří hexokináza? Lyázy Transferázy Ligázy Oxidoreduktázy.
Některé významné reakce jsou katalyzovány multienzymovými komplexy V rámci citrátového cyklu je takovým komplexem oxoglutarát-dehydrogenázový komplex Součástí komplexů dýchacího řetězce je malát – dehydrogenázový komplex Základní enzymové aktivity komplexu syntézy mastných kyselin jsou součástí jednoho proteinového řetězce
Enzymové aktivity fosfofruktokinasy i fruktosa 1,2 – bisfosfatasy jsou součástí jednoho proteinového řetězce.
ΔG může být ovlivněno: změnou teploty změnou pH změnou rovnovážné konstanty reakce změnou EA .
Když měříme Km a Vmax, musí být splněné podmínky: rychlost vzniku ES musí růst d[ES]/dt~0 [S] je blízká stavu v t=0 a P přibližně 0 .
ΔG katalyzované reakce: ΔG souvisí s rychlostí reakce ΔG souvisí s rovnovážnou koncentrací ΔG souvisí se změnou aktivační energie .
Co vzniká heterolytickým a homolytickým dělením vazby C-H: při heterolytickém štěpení vzniká karbaniont a H+, toto štěpení je nejčastější v živých soustavách při homolytickém štěpení vzniká karbaniont a H+, toto štěpení je nejčastější v živých soustavách při homolytickém štěpení vzniká dvojice radikálů při heterolytickém štěpení vzniká karbkationt a H-, především je-li přítomen FAD.
Počet chirálních center v ribose se sníží: fosforylací přidáním nějaké skupiny záměnou OH za H linearizací.
Vyberte pravdivá tvrzení o N-glykosilaci: vzniká spojením NH2 skupiny aspartátu s C1 cukru, většinou N-acetylglukosaminu vzniká propojením N a COOH vzniká spojením přes amidovou skupinu .
Alespoň jeden anomerní uhlíkový atom v následujících sacharidech není součástí glykosidické vazby, ani není oxidován. Vyberte molekulu, pro kterou toto tvrzení platí: kyselina glukuronová kyselina N-acetylmuramová maltóza sacharóza .
Které z následujících tvrzení platí o vazbě cukrů v N-glykoproteinech? vazba cukru probíhá prostřednictvím NH2 skupiny argininu, nejčastěji v beta konfiguraci vazba cukru probíhá prostřednictvím dusíku acetylglukosaminu a COOH skupiny aspartátu vazba cukru, nejčastěji N-acetylglukosaminu, probíhá prostřednictvím acetylu na C2 a NH2 skupiny na proteinu vazba cukru, nejčastěji N-acetylglukosaminu, probíhá prostřednictvím amidové skupiny NH2 asparaginu a C1 cukru.
Jak vznikají aldonové a uronové kyseliny? oxidací na C1 cukru slabými oxidačními činidly vznikají aldonové kyseliny oxidací na C6 cukru silnými oxidačními činidly vznikají uronové neboli alduronové kyseliny laktony vznikají cyklizací jedné z těchto kyselin s nějakou OH skupinou stejného řetězce glukuronová kyselina vzniká oxidací alkoholové skupiny na C6 na karboxylovou tvorbou pyranóz a furanóz u uronových kyselin vznikají laktony.
Aldonové i uronové kyseliny jsou biologicky velmi významné složky mukopolysacharidů i proteoglykanů. Posuďte správnost tvrzení: karboxylová skupina aldonových kyselin vzniká mírnou oxidací aldehydové skupiny příslušných aldóz karboxylová skupina uronových kyselin vzniká oxidací keto skupiny odpovídajících ketóz karboxylová skupina kyseliny D-glukuronové je na místě primární alkoholové skupiny na C6 pyranosové či furanosové formy urnových kyselin se nazývají laktony .
Sacharóza je syntetizována z UDP-glukózy a fruktóza-6-fosfátu je syntetizována z CDP-glukózy a fruktózo-6-fosfátu.
Glykolýzu lze charakterizovat jako: dekarboxylaci dehydrogenaci dehydrataci .
Místem substrátové fosforylace (fosforylace ADP na ATP) v glykolýze je reakce: hexokinasy fosfofruktokinasy glyceraldehyd-3-fosfátdehydrogenasy fosfoglycerátkinasy .
Do glykolýzy mohou vstupovat různé hexosy galaktóza je fosforylována galaktokinasou na galaktosu-6-fosfát, který je substrátem hexosafosfátizomerasy fruktóza je ve svalové tkáni substrátem hexokinasy a tak vzniká přímo fruktosa-6-fosfát fruktóza je v játrech substrátem fruktokinasy a tak vzniká přímo fruktosa-6-fosfát fruktóza je v játrech substrátem fruktokinasy a tak vzniká fruktosa-1-fosfát, který je substrátem fosfofruktokinasy.
Posuďte pravdivost následujících tvrzení o aldolasové reakci v glykolýze. Mějme na mysli aldolasy třídy I u živočichů substrátem je hexosa, která dává vznik dvěma aldotriosám substrátem je fruktosa-1,6-bifosfát, který vytváří Schiffovu bázi (iminiový kationt) s enzymem substrátem je fruktosa-1,6-bifosfát, přičemž fosforylace na obou uhlících je nezbytná pro aldolasy I.A při katabolismu fruktosy v játrech je přítomna aldolasa I.B, která štěpí fruktosu-1-fosfát.
Které tvrzení o mechanismu pyruvát dekarboxylasy je pravdivé? Substrát je dekarboxylován po připojení na lipoyllisylové raménko Substrát je dekarboxylován po připojení na TPP Lipoyllisylové raménko je po odevzdání acetyl-CoA redukované a musí se oxidovat Lipoyllisylové je po odevzdání acetyl-CoA oxidované a musí se redukovat.
Ribóza 5P vzniká v pentózovém cyklu: ribulosou 5 P isomerasou xylulosou 5 P epimerasou fru 6 P a GAP transketolasou sedoheptulosou 7 P transaldolasou a erythrosa 4 P transaldolasou.
Co probíhá, nebo vzniká oxidačními reakcemi v pentofosfátové dráze? NADPH a glyceraldehyd-3-fosfát oxidativní dekarboxylace aldolasové štěpení .
Která dvojice enzymů je regulována jednou látkou s reciprokým efektem: fosfoenolpyruvát karboxykinasa a pyruvátkinasa fruktosa 1,6 bisphosphatasa a fosfofruktokinasa glukosa 6 fosfatasa a glukokinasa glukosa 6 fosfatasa a hexokinasa .
Oxidace glukosy poskytne 36 až 38 ATP, předpokládejme, že je to 36 ATP – rozhodněte, jestli výtěžky souhlasí: pyruvát -> 15 ATP fruktosa-1,6-bisfosfát -> 38 ATP fosfoenolpyruvát -> 16 ATP dihydroxyacetonfosfát -> 17 ATP DHAP -> 19 ATP.
Co se uplatňuje v glukoneogenezi: konverze malátu na oxaloacetát štěpení ATP PEPCK isocitrát lyasa.
Glykogenfosforylasa: je přímo aktivována glykogenfosforylasou kinasou je inhibována fosfoproteinfosfatasou I je přímo aktivována vysokou hladinou cAMP je aktivována Ca2+.
Proteiny Ca2+ se účastní regulace metabolismu glykogenu ve svalu tak, že: aktivují prostřednictvím kalmodulinu protein kinasu A – PKA alostericky aktivují glykogensynthasu se váží na δ-podjednotku kinasy fosforylasy aktivují glykogensynthasu prostřednictvím kalmodulin-dependentní proteinkinasy.
Insulin stimuluje vstup glukosy do svalových buněk vstup glukosy do jaterních buněk syntézu glykogenu v játrech prostřednictvím fosforylace glykogensynthasy syntézu glykogenu v játrech prostřednictvím aktivace proteinkinasy A.
Vnitřní mitochondriální membrána: je nepropustná pro NADP, redukční ekvivalenty jsou předávány na první komplex z vnější strany membrány je nepropustná pro NADP, redukční ekvivalenty jsou předávány prostřednictvím transportních cyklů (malát aspartátový a glycerolfosfátový) nepropustná pro ATP. to pak musí byt transportováno na účet membránového potenciálu vnitřní membrány nepropustná pro ATP, takže ATP musí byt vyměněno za ADP cytosolickým .
Q cyklus se uplatňuje při: přenosu elektronů v rámci cytochrom-oxidasy rotaci pohyblivé části komplexu FoF1 ATP-synthasy reakcích komplexu III postupné redukci molekuly kyslíku na vodu.
Cytochrom c je součástí řetězce transportu elektronů v mitochondriích. Cytochrom c: je součástí transmembránového komplexu cytochrom-oxidasy (komplexu IV), spolu s cytochromy a a a3 je součástí transmembránového komplexu ubichinol-cytochrom c-reduktasy (komplex III), spolu s cytochromy b a c1 není membránovým proteinem obsahuje železo, a to jako součást hemové prostetické skupiny .
Cytochrom c: funkčně spojuje komplex II a komplex IV přenáší právě jeden elektron .
Při oxidativní fosforylaci jdou elektrony z komplexu I: na CoQ na komplex II a pak na CoQ na komplex III a pak na CoQ na CoQ a pak na komplex II .
Koenzym Q: přenáší elektrony mezi komplexem I a III přenáší elektrony mezi komplexem II a III v rámci Q-cyklu přenáší 2 protony na každý elektron přenesený na cytochrom c1 v rámci Q-cyklu přenáší jeden proton na každý elektron přenesený na cytochrom c1 .
Jaké transportní systémy jsou přítomny na vnitřní mitochondriální membráně: antiport ATP-ADP antiport NAD+/NADH translokátor pro karnitin antiport malát-aspartát .
F0F1-ATPáza...jak probíhají reakce, když je obrácena v mitochondriální membráně opačným směrem? když nefunguje protonový gradient a dodáme do vnějšího (intermembránového) prostoru ATP, bude probíhat její degradace(na ADP) a FOF1-ATPáza se bude točit obráceným směrem to samé, ale FOF1-ATPáza se bude otáčet stejným směrem nefunkční protonový gradient, ale ATP z vnější strany mitochondriální membrány bude přenášena dovnitř mitochondrie a poté teprve reakce s FOF1-ATPázou bude funkční protonový gradient, [H] in>[H] ex a ATP bude vznikat z ADP a P na alfa, beta podjednotkách .
Vyberte správné tvrzení: NADH v cytoplasmě přenáší e- přímo na komplex I v membráně NADH přenáší e- do oxidačního řetězce pře glycerolfosfátový a malát-aspartátový cyklus komplex III přenese 2H+ na každý e- z CoQ.
FAD se využívá v mitochondriích místo NADH, který není možno přenášet přes mitochondriální membránu je využíván v mitochondriích při malát-aspartátovém cyklu přenáší 2e- a 2H+ a současně NAD přenáší 2e- a 1H+.
Isocitrátlyáza katalyzuje dehydratací isocitrátu na cis akonitát dekarboxylaci isocitrátu na oxoglutarát štěpení isocitrátu na sukcinát a oxalacetát štěpení isocitrátu na sukcinát a glyoxylát.
Z následujících aminokyselin vyberte takové, které jsou všechny katabolizovány na společný meziprodukt Krebsova cyklu: Ala, Leu, Ile, Met G, S, Q, N Lys, Leu, Ser, Cys P, E, N, R.
Vysoké hladiny citrátu v buňce signalizují dostatek energie: proto citrát alostericky aktivuje karboxylasu acetyl-CoA proto citrát snižuje aktivitu pentosofosfátové dráhy proto citrát alostericky aktivuje malátdehydrogenasu proto citrát v játrech snižuje vstup glukosy do buněk.
Unikátní vlastností biologických membrán jsou založeny na přítomnosti řady amfipatických molekul: fosfatidylinositoly obsahují inositol esterifikovaný dvěma mastnými kyselinami fosfatidylcholiny obsahují glycerol esterifikovaný dvěma mastnými kyselinami sfingolipidy obsahují aminoalkohol sfingosin esterifikovaný dvěma mastnými kyselinami lysofosfolipidy vznikají z fosfolipidů působením fosfolipázy.
Správné tvrzení: fosfolipáza A1 štěpí C1-C2 vazbu na glycerolu fosfolipáza A2 štěpí C1-C2 vazbu na glycerolu působením fosfolipázy D vzniká kyselina fosfatidová působením fosfolipázy C vzniká lysofosfolipid .
Oxidace nenasycených mastných kyselin, například kyseliny linolové, vyžaduje přítomnost dvou enzymů (navíc k enzymům přítomným) – které to jsou: isomerasa, která transformuje 3,4-cis,6,7-cis enoyl CoA na 2,3-trans,6,7-cis enoyl CoA isomerasa, která transformuje 3,4-cis,6,7-cis enoyl CoA na 2,3-trans,7,8-trans enoyl CoA specifickou hydratasu, která transformuje 2,3-cis enoyl CoA na D-3-hydroxyacyl CoA specifickou epimerasu, která transformuje D-3-hydroxyacyl CoA na L-3-hydroxyacyl CoA.
Odbourávání mastných kyselin s dvojnými vazbami v molekule vyžaduje přítomnost dodatečných enzymů, navíc k těm, které v dráze β-oxidace fungují pro mastné kyseliny nasycené. Navíc musí být k dispozici specifická thiolaza specifická reduktasa specifická hydratasa specifická isomerasa .
Rozdíly metabolismů mastných kyselin při syntéze a degradaci v živočišné buňce Syntéza probíhá v cytosolu, degradace v mitochondriích. Aktivace mastných kyselin při degradaci ovšem probíhá již v cytosolu Syntéza využívá FADP, degradace využívá NAD a FAD Při degradaci vzniká (hydratací) L-β-hydroxyacylová skupina, při syntéze je to D-β-hydroxyacylová skupina Acetyl-CoA- karboxylasa se účastní degradace jako monomerní enzym, syntézy jako oligomerní enzym.
Ketonové látky a jejich životní role v organismu Ketonové látky zejména acetoacetát a D-3- hydroxybutyrát jsou generovány především v jaterních mitochondriích Ketonové látky acetoacetát a D-3- hydroxybutyrát jsou vytvářeny z acetyl-CoA Ketonové látky (…..) jsou vytvářeny ze Sukcinyl-CoA Ketonové látky acetoacetát a D-3- hydroxybutyrát, který vzniká redukcí acetoacetátu jsou využívány jako zdroj energie svalovou tkání.
Adipocyty slouží k ukládání a případnému opětnému mobilizování tukových zásob. O původu molekul triacylglycerolů v adipocytech lze říci: byly syntetizovány v játrech z volných mastných kyselin byly syntetizovány v adipocytech z volných mastných kyselin byly absorbovány ve střevě a přeneseny k adipocytům prostřednictvím chylomikronů byly syntetizovány z mastných kyselin, které byly vytvořeny de novo v játrech .
Která tvrzení o cholesterolu jsou pravdivá: jeho prekurzorem je β-hydroxy-β-methylglutaryl-CoA (HMG-CoA) všechny jeho uhlíky pocházejí z acetylu skvalen je složen z 8 izoprenových jednotek je přítomen v plasmatické membráně je prekurzorem vitaminů.
Do močovinového cyklu vstupuje: aspartát fumarát.
Kyselina močová: kyselina močová je u plazů, ptáků a primátů posledním krokem degradace purinu u člověka degradována až na močovinu u vodních bezobratlých a ryb až na NH3.
Transaminace mají nezastupitelnou úlohu v metabolismu aminokyselin. Tyto enzymy ( A – NH2 + B vznikne A+B-NH2) Vytvářejí Schiffovu bázi mezi koenzymem a aminokyselinou enzymu Vytvářejí Schiffovu bázi mezi koenzymem a substrátem Vyžadují vazbu obou kyselin na enzym současně Využívají mechanismus, při kterém spolu substráty na povrchu enzymu přímo neinteragují.
Metabolismus serinu: Serin je glukogenní, neboť poskytuje při odbourávání pyruvát Serin je ketogenní, neboť poskytuje při odbourávání acetaldehyd Serin – hydroxymethyltransferáza využívá jako koenzym pyridoxal-fosfát Serin-hydroxymethyltransferáza využívá jako koenzym thiamin-difosfát.
S-adenosylmethyonin – SAM: vzniká při degradaci methioninu se účastní methylace adrenalinu při vzniku noradrenalinu je methylován N5,N10-methionin THF obsahuje adenin obsahuje atom síry poskytuje metylovou skupinu poskytuje thiolovou skupinu.
S-adenosyl-methionin (SAM) slouží jako donor při biosyntetických methylacích Po methylaci může být SAM regenerován v reakcích zahrnujících N5 – methyltetrahydrofolát jako zdroj methylové skupiny Jelikož SAM vzniká jako meziprodukt při odbourávání methioninu, může z něj vzniknout sukcinyl –CoA SAM funguje při syntéze fosfatidylethanolaminu z fosfatidylcholinu SAM funguje při syntéze adrenalinu z noradrenalinu .
Při katabolismu některých aminokyselin se uplatňuje dehydrogenace, při které s pomocí FAD vzniká dvojná vazba, následovaná hydratací a dehydrogenací za pomoci NAD+. Posuďte, zda k nim následující aminokyseliny patří: I R V T.
Katabolismus purinů končí: kyselinou močovou u plazů alantoinem u všech savců s vyjímkou primátů alantoovou kyselinou u kostnatých ryb močovinou u kostnatých ryb amoniakem u mořských bezobratlých.
Tvorba deoxyribosových nukleotidů. Posuďte následující tvrzení: Tvorba probíhá syntézou de novo s využitím deoxyribozy Tvorba probíhá redukcí odpovídajících ribonukleotidů ribonukleotid-reduktázami Deoxyribonukleotid obsahující thymin vzniká methylací dUTP Deoxyribonukleotid obsahující thymin vzniká methylací dUMP.
Acetyl CoA je tvořen v mitochondriích oxidativní dekarboxylací pyruvátu β-oxidací mastných kyselin v reakcích Krebsova cyklu v reakcích pentózové dráhy .
|
